李士珍对唐纵俄然来这一手，非常气愤。
唐纵对同一天下差人机构的指纹事情，曾请过很多所谓“专家”来研讨。传闻，差人采取指纹登记已实施了一二十年，在个别多数会的差人局里设有主管指纹的单位，因为搞指纹事情的职员，有的学德国，有的又别离学英、美、奥、法、日。都是各搞一套，是以非常混乱。常常在甲地犯过案的人，到乙地再犯案后，警察采纳指纹时，因体例不分歧，分类归档各有分歧，调阅档案时便产生很多困难，不能阐扬应有的感化。颠末一些专家的研讨后，决定采取同一的规定：凡采纳两手十指指纹时，一概采取亨利爱德华式；采纳单指纹时，一概采取白脱里式。这是因为这两种体例分类简练较着易于推行，畴昔采纳指纹的纸型也很庞杂，有的过简，也有的过于烦琐，这时由差人总署同一规定标准格局，分发到各省市警局实施。
第五件使他伤脑筋的事是差人不能免除兵役的题目。
唐纵为实现这一打算，于1947年6、7月间，亲身跑到浙江、福建等省去商谈，但愿有几个省能率先做到真正的警保合一。成果到处碰钉子，他不得不退而求其次，但愿能由警保处把握到各县的保安队。这一让步，也只是获得大要上的同意，实施起来还是题目很多。各县县长也同省主席一样，以为本身要抓住县保安队这一点点气力才行。如许一来，各县又不竭产生差人与保安队争权的抵触，唐纵为了这些题目，经常弄到深夜都不能入眠，厥后只好拟具一个“警保侵占队队员职务分别体例”签报蒋介石由内政部通令各省实施。
1946年7月，蒋介石任命唐纵为内政部差人总署署长，免除他内政部政务次长的职务。当时，唐纵非常欢畅，因他从没有做过主管官，对如许一个署长已感到心对劲足了。而很多筹办转到差人界去仕进的大间谍却很绝望，公开里说：“唐纵先生到手了，我们却没有下落。”
和谈分裂今后，蒋介石悍然不顾统统命令遣送中共职员回延安时，唐纵立即收回唆使，号令各地差人局长实在当真履行，监督中共职员全数撤离，并当真查明是否仍有中共职员留下持续停止活动。唐纵对此非常当真，曾密令重庆差人局刑警处长谈荣章对留下的中共职员奥妙拘系，或逼迫留下的中共职员自首。唐纵的密令中还规定，这项号令要由各级主官亲身卖力履行，不能作为普通例行公文对待，如履行不力要遭到峻厉处罚。
此案虽经调剂，但两边各执一词，都向蒋介石告状，要求严惩对方。蒋介石大发脾气，把唐纵和国防部次长秦德纯叫去痛骂一顿，责令他们两人迅即查个水落石出。唐纵奉令后，又以为是件大伤脑筋的事。第二天，唐纵去到上海亲身停止调查。他除了听取上海差人局长俞叔平的陈述外，还把保密局上海站长刘芳雄、上海市当局调查室主任王新衡、戒备司令部稽查处长陶一珊以及在差人局事情的军统间谍派去研讨，并从各方汇集质料。唐纵在上海搞了一个礼拜摆布，总算把事情本相弄明白，肯定是宪兵先开枪打死了差人，差人才停止反击。
抗日战役开端今后，蒋介石极力扩大间谍构造，将本来军委会调查统计局第一处改组为中心党部调查统计局，将军统局交与戴笠。这时，蒋介石感到在他身边需求一个可靠的人来替他主管各方面的环境。戴笠体味到这一环境，便向蒋介石保举唐纵担负这一职务。当时唐纵仍任军统局书记长，因为畴昔曾在蒋介石身边搞过这项事情，很快就获得蒋介石的批准，将唐纵调为侍从室参谋，主管谍报停业。唐纵再度去到蒋介石的摆布，比畴昔更加卖力。抗战期间，蒋介石到重庆后，为了集合权力便于他实施法西斯独裁统治，将侍从室的构造和权力予以扩大，建立了4个处，把军事、政治、人事、党务、财经等全都抓在身边。侍从室第一处中设立6个组，唐纵便被晋升为第六组少将组长（原为上校参谋），仍主管谍报停业。