1.骨架：全部纳米机器的根基框架，由高分子聚合物构成，其化学布局内搭载了事情法度，因为原子堆积的运转流程是一样的，以是同一种用处的纳米机器骨架的构成根基是分歧的。
第一步，空载（既没有照顾能源物质分子，也没有照顾素材原子）的纳米机器，从培养液中吸附一个能源物质分子（以下以atp为例），此时化学吸盘、物质提取与开释部分均无活性。
缺点：第一，纳米机器堆积如同长指甲，堆积速率较为迟缓；第二，对投入培养槽的质料要求较高，普通都需求颠末开端加工，如果要改换需求培养的物质，必须增加新的纳米机器，操纵常常比较困难，是以分歧适小量质料的加工。第三，因为是近似发展的培养体例，成品就是一整块的物质块，尚需后续加工，特别是高机能或者比较脆弱的材质，后续加工常常会比较困难。
技术专题――纳米机器原子堆积技术
2.其次，纳米机器必须能辨认搬运位置的大要，并按照大要原子堆积的环境将素材原子安排到合适的位置，或者按照此提取需求的物质。凡是的对策是采取化学吸盘（详见后述）。
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后续措置（本段红字加粗）：为了制止纳米机器或相干活性物质流入天然引产生态变乱，纳米机器的培养槽必须谨防泄漏，投入的纳米机器必须颠末专门检测，确认合格火线可投入利用，出厂的成品亦必须停止生化兵器净化级别的严格洗消，其废水必须颠末公用沉淀剂和消毒剂措置，完整粉碎此中的纳米机器，经检测合格方能排放。
第二步，吸附atp的纳米机器，在atp已吸附与未照顾素材原子两个前提下，提取部分的化学吸盘活性化，借此附着到素材物质大要。